コマンドラインで設定するには？

NTFSパーティション上の圧縮状況確認その他はコマンドでも可能なので、試してみてくださいませ。ヘルプから一応引っ張ってみたりで・・・。

注）このコマンドについては、NTFS環境からのみになりますので、
ご注意ください。

compact [{/c|/u}] [/s[:dir]] [/a] [/i] [/f] [/q] [FileName[...]]

■/c
指定したファイルまたはディレクトリの圧縮

■/u
指定したファイルまたはディレクトリの圧縮解除

■/s:dir
圧縮または圧縮の解除を、指定したディレクトリやサブディレクトリに対しておこなうので、指定していない場合は現在のディレクトリに対しておこないます

■/a
隠しファイルまたはシステムファイルを表示します

■/i
エラーを無視します

■/f
指定したファイルまたはディレクトリを強制的に圧縮または圧縮解除します。システム クラッシュなどで圧縮処理が中断され、ファイルが部分的に圧縮されているような場合に使用します。部分的に圧縮されているファイルを完全に圧縮するには、/c および /f パラメータと共にそのファイルを指定します。

■/q
最も重要な情報だけをレポートします。

■/q FileName
ファイルまたはディレクトリを指定します。複数のファイル名およびワイルドカード文字 (* と ?) を指定できます。

■/?
コマンド プロンプトにヘルプを表示します。